高浓度废酸、废碱液需中和至中性后再行排放。对于含有少量被测物及其他试剂的高浓度有机溶剂，应进行回收再利用。回收用的高浓度废液需集中存储，以便后续回收操作；低浓度废液经处理达标后排放。实验室废液收集时应依据废液性质确定其储存容器与条件，通常不同性质的废液禁止混合，且需避光、远离热源，防止发生不良化学反应。储存废液的容器必须张贴标签，注明废液种类、储存时间等关键信息。
含汞、铬、铅、镉、砷、酚、氰的废液必须经过妥善处理，达到排放标准后方可排放，实验室处理方法如下：
含汞废液处理：若实验室发生金属汞散落（如温度计破裂）情况，务必及时清理。可使用滴管或在硝酸汞酸性溶液中浸泡过的薄铜片、铜丝收集汞至烧杯，并用水覆盖。地面散落的汞颗粒可撒上硫磺粉，转化为毒性较低的硫化汞；也可喷洒经盐酸酸化的高锰酸钾溶液（体积比 5：1000），1 - 2 小时后清除；还可喷洒 20% 三氯化铁水溶液，待干燥后清除（但此方法不适用于金属表面，会造成腐蚀）。对于含汞废液，先将其 pH 调至 8 - 10，加入过量硫化钠，促使生成硫化汞沉淀，再添加硫酸亚铁作为共沉淀剂，硫化铁沉淀可吸附硫化汞微粒共同沉淀，静置分离后，清液可排放，残渣可通过焙烧法回收汞或制备汞盐。
铅、镉废液处理：利用碱将废液 pH 调节至 8 - 10，使铅、镉分别形成 Pb (OH)₂和 Cd (OH)₂沉淀，接着加入硫酸亚铁作为共沉淀剂，沉淀物可与其他无机物混合后进行烧结处理，处理后的清液予以排放。若无法及时处理，应集中存放在废液桶中。其处理流程为：废水先加入 pH 调节剂，再加入除汞剂，随后加入凝聚剂，再次加入 pH 调节剂，最后加入絮凝剂，对上清液进行汞含量测试后固液分离。
含铬、砷、酚、氰废液处理
含铬废液：向含铬废液中加入还原剂（如硫酸亚铁、亚硫酸钠、铁屑），在酸性条件下将六价铬还原为三价铬，然后加入碱（如氢氧化钠、氢氧化钙、碳酸钠等），使三价铬形成 Cr (OH)₃沉淀，清液可排放。沉淀干燥后可采用焙烧法，与煤渣共同焙烧后填埋处理。
含砷废液：加入氧化钙调节 pH 至 8，使砷生成砷酸钙和亚砷酸钙沉淀，在 Fe³⁺存在时共沉淀；或调节溶液 pH 大于 10，加入硫化钠，与砷反应生成难溶、低毒的硫化砷沉淀。产生含砷气体的实验务必在通风橱内进行。
含酚废液：低浓度含酚废液可加入次氯酸钠或漂白粉，将酚氧化为水和二氧化碳。高浓度含酚废液可使用丁酸乙酯萃取，再用少量氢氧化钠溶液反复萃取，调节 pH 后重蒸馏提纯使用。
含氰废液：低浓度废液用氢氧化钠调节 pH 至 10 以上，加入 3% 高锰酸钾粉末，使氰化物分解。高浓度废液采用碱性氯化法处理，先碱调 pH 至 10 以上，加入次氯酸钠或漂白粉，充分搅拌使氰化物分解为二氧化碳和氮气，放置 24 小时后排放。含氰化物废液严禁乱倒或与酸混合，以免生成剧毒的挥发性氰化氢气体。
综合废液处理：先用酸、碱调节废液 pH 至 3 - 4，加入铁粉搅拌 30 分钟，再用碱调节 pH 至 9 左右，继续搅拌 10 分钟，接着加入硫酸铝或碱式氯化铝混凝剂进行混凝沉淀，上清液可直接排放，沉淀按废渣方式处理。具体操作流程为：向综合废液中依次加入酸性溶液、碱性溶液调节 pH，加入铁粉搅拌，再加入硫酸铝或碱式氯化铝混凝剂，实现上清液混凝沉淀，分离出沉淀废渣。
三氯甲烷的回收：三氯甲烷废液依次用水、浓硫酸（用量为三氯甲烷量的十分之一）、纯水、0.5% AR 盐酸羟胺溶液洗涤，再用重蒸馏水洗涤两次，然后用无水氯化钙脱水，静置数日后过滤、蒸馏。蒸馏速度控制在每秒 1 - 2 滴，收集沸程为 60 - 62 摄氏度的馏出液，保存于棕色试剂瓶中（可使用橡胶塞）。
尽量回收溶剂，在不影响实验的前提下重复使用。
为便于处理，废液收集分类通常包括：a. 可燃性物质；b. 难燃性物质；c. 含水废液；d. 固体物质等。
可溶于水的物质易随水溶液流失，回收时需特别留意。不过，甲醇、乙醇及醋酸等溶剂易被细菌分解，其稀溶液经大量水稀释后可排放。
含重金属的废液，在分解有机质后按无机类废液处理。
选用无破损且耐废液腐蚀的容器收集废液，并在容器上显著标注所收集废液的成分及含量，存放于安全位置。
对硫醇、胺等有臭味的废液，以及会产生氰、磷化氢等有毒气体的废液和易燃性强的二硫化碳、乙醚等废液，需妥善处理，防止泄漏，并及时处置。
含有过氧化物、硝化甘油等爆炸性物质的废液，操作务必谨慎，且应尽快处理。
含有放射性物质的废弃物，需单独收集，并严格遵循相关规定，严防泄漏，谨慎处理。
过氧化物与有机物不可混合。
氰化物、硫化物、次氯酸盐与酸禁止混合。
盐酸、氢氟酸等挥发性酸之间不能混合。
浓硫酸、磺酸、羟基酸、聚磷酸等酸类与其他酸不得混合。
铵盐、挥发性胺与碱不能混合。
